Son yıllarda meme kanseri, klinik ve moleküler mekanizmaları açısından en iyi analiz edilen tümörlerden biri olmuştur. Meme kanseri sınıflandırması geçmişte sadece histopatolojik olarak yapılırken, hastaların klinik durumlarının farklı seyrettiği ortaya çıkmıştır. Bu nedenle meme kanseri olan hastalarda prognostik faktörler kullanılmaktadır. Prognostik faktörler, tümör çapı, lenf nod metastazı, tümörün tipi, tümör proliferasyon indeksi, hormon reseptörleri ve moleküler prognostik faktörler şeklinde sıralanabilir. Meme kanserinde mikro-array tabanlı gen ekspresyonu çalışmaları sonucunda luminal A, luminal B, bazal benzeri ve HER2-pozitif olmak üzere 4 ayrı moleküler alt tip tanımlanmıştır. Bu sınıflamaya göre tedavi grupları belirlenmiştir. Meme kanserinde immünohistokimyasal ve moleküler markerların doğru ve güvenilir çalışabilmesi için dikkat edilmesi gereken noktalar vardır. Örneklenen dokuların doğru şekilde fikse edilmesi ve kontrol dokularıyla çalışılması önemlidir. HER2'nin immunohistokimyasal yöntemle değerlendirilmesi de belirli skorlarla yapılır. Son yıllarda PDL-1'in keşfiyle birlikte bazal benzeri moleküler alt tipte yeni tedaviler başlamıştır.(AI)