Multilocus Sequence Typing (mlst) Yöntemleri: Prensipleri, Metodoloji Ve Kullanım Alanları
Anahtar Kelimeler
Multilocus sequence typing (MLST), mikroorganizmaların genomu üzerindeki korunmuş gen bölgelerini kullanarak mikroorganizmaları tiplendiren bir moleküler mikrobiyolojik yöntemdir. Bu yöntem, mikroorganizmaları sekans tiplerine (ST) göre sınıflandırır ve genellikle 5-7 korunmuş gen bölgesinin DNA dizilemesi yaparak her bir bölge için bir numara ve bütünü için bir ST numarası elde eder. MLST yöntemi, klasik MLST ve çeşitli modifikasyonlarla kullanılmaktadır. Bu yöntem, birçok alanda kullanım bulmaktadır, örneğin genotiplerin belirlenmesi, moleküler epidemiyolojiye dayalı sürveyans, suş izleme, taksonomi güncelleme çalışmaları, atasal DNA araştırmaları, bulaşıcı hastalıkların izlenmesi ve ulusal genom veri bankalarının oluşturulması gibi. Klasik MLST yöntemi, genellikle yedi \"housekeeping\" gen bölgesinin DNA dizilemesiyle çalışır ve elde edilen alelik dizileri uluslararası veri tabanlarıyla karşılaştırılarak tipleme sonuçları yorumlanır. Bu yöntemin avantajları arasında küresel epidemiyolojiye uygun olması, tekrarlanabilir ve karşılaştırılabilir olması, internet üzerinden veri erişimi ve saklama imkanı sağlaması, diğer izolatlarla hızlı ve doğru karşılaştırma yapabilme, aynı alelik profile sahip izolatların sayısını vermesi ve köken araştırmalarına katkı sağlaması bulunmaktadır.(AI)
Atıf Sayısı :
